《假面骑士Ex-aid 特别结尾》讲述了游戏公司“玛克尼视觉”的假面社长乔恩·马克西马为了测试新开发的虚拟现实病毒——BugStar Virus，在游戏中植入了风魔和忍者玩家。骑士作为实验的假面一部分，他选择了身患绝症、骑士仅剩几个月生命的假面少女麻美作为主要实验对象。随着新型病毒在虚拟现实中扩散开来，骑士许多玩家陷入昏迷，假面其中包括飞彩、骑士大我以及连BUGSTAR怪人波比也中招。假面在游戏中，骑士麻美却表现得充满活力，假面与病毒的骑士原设计者南云影成的想法不谋而合。与此同时，假面在现实世界中的骑士主人公永梦和伙伴们必须穿越虚拟世界的重重挑战，寻找恢复玩家意识的假面方法，并揭开“玛克尼视觉”背后的阴谋。在此过程中，他们还将面对贵一矢这位神秘人物的身影。随着剧情不断推进，这群年轻的医生与骑士们逐渐揭开了游戏背后的黑暗真相：乔恩·马克西马的真实目的究竟是什么？永梦和他的团队能否成功拯救玩家并改变他们的命运呢？让我们一同期待这场虚拟与现实交织的生死较量吧！